“空军一号”拥有先进的防护措施以保护美国总统的安全，足以抵御核爆炸所产生的核辐射及冲击波，能发射红外诱饵或启动电子干扰系统，防范导弹攻击。此外，任何人携带任何行李登机时，都要经过十分严格的安检。至于“空军一号”上的总统套房、通讯中心以及驾驶室，更是只有少数的特许人士才能够进入。