大千世界，万物生生不息，物质循环转化，原因是自然界中存在的物质循环链。生物循环是最基础的循环之一，植物、动物、微生物，三大类生物构成了生物循环主链，其中植物是生产者，动物是消费者，微生物是转化还原者。

微生物在生物循环中起着核心环节的作用。作为生物资源，微生物具有三大优势：1)生物多样性极为丰富无所不在，无所不能(人类发明塑料只有数十年的历史，很快就有了分解塑料的微生物) 。 2)生长繁殖快。昼夜间可以成亿倍增殖(养猪养鸡要几个月，而生产微生物产品只要一个昼夜!)。3)天然生物，对环境无害。这些特性使微生物成为了极具开发潜力的巨大资源。

人类的种植业是开发植物资源，养殖业是开发动物资源，由于在农业上对微生物的认识和利用有限，这就造成一种资源浪费的“二元结构”模式。在这种模式下我国目前大约有20亿吨农作物秸杆和19 亿畜禽废气物不能充分转化利用，造成了巨大的资源浪费，也给生态环境构成了巨大压力。

只有将植物、动物、微生物三大类资源同等重视开发，构建能够循环的“三元结构”模式，遵循生物循环规律，农业才能够可持续发展。钱学森曾指出，微生物资源在农业上的开发利用将是第六次产业革命重要内容。

开展养殖生态治理，实现畜牧业的可持续发展，微生物技术将起到不可替代的作用，解决的核心问题是治理污染。养殖治理必须从整体出发，进行系统治理。畜禽粪便中含有大量有机氮、有机磷，是产生不良臭气的根源，也是影响冲洗废水量的关键，因而是治理的关键环节。关键环节还包括以下几个方面：

一，在饲料中采用微生物技术，通过添加微生物代谢产品、微生态制剂、微生物酶制剂和使用生态饲料可以有效地提高饲料转化率。减少氮和磷等主要有机物的排放。目前国际上已有数十种微生物、微生物酶、已被批准用于饲料的直接添加，可以用于绿色畜产品和有机畜产品的生产。

二，应用微生物生态产品提高畜禽的抗病能力、减少腹泻等疾病发生。畜禽生病后，消化功能下降有机物排除增多。疾病是影响养殖效益的最不可控因素，提高抗病能力始终是生态养殖的重要环节。

三，微生物臭气治理。在养殖场的圈舍、粪堆、粪坑中喷洒微生物制剂可以有效减少臭气的产生。这些微生物包括酵母菌、芽抱菌、乳酸菌等。

四，微生物处理畜禽粪便。运用微生物技术对畜禽粪便生物无害化处理，可以生产制成有机肥，食用菌培养沼气，达到变废为宝的目的。适当的工程措施，为微生物提供适宜的生长条件是实现上述目的的保障。菌种包括高温芽孢菌、放线菌等。沼气技术实际上也属于微生物技术。

五，微生物处理养殖废水。微生物技术在废水处理过程中已经广泛使用，使养殖废水达标排放、循环使用以及用于水产养殖。

通过以上几个方面微生物技术的综合应用，达到提高饲料效益、提高抗病能力、减少养殖废物的产生以及废弃物的无害化利用等，不仅治理污染，而且可以大大提高养殖业的综合效益。在此基础上，可以大大减少抗生素等添加剂的使用，提高产品安全，提高产品品质，提高经济效益。