中国与哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、俄罗斯、塔吉克斯坦和乌兹别克斯坦六国组成的上海合作组织机制化建设不断完善。在2003年5月上海合作组织成员国元首莫斯科峰会上，中国国家主席胡锦涛同五国元首一道签署和批准了《上海合作组织成员国元首宣言》和九份规范上海合作组织会议机制和常设机构运作的法律文件。9月，中国国务院总理温家宝与其他五国总理在北京举行会晤，六国总理签署决议，批准了《上海合作组织成员国多边经贸合作纲要》等一系列文件。2004年1月15日，上海合作组织秘书处和地区反恐怖机构分别在中国首都北京和乌兹别克斯坦首都塔什干正式启动。